Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms