Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms