Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms