Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ39

DDX50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX50Q9BQ39 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms