Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3AQ99856 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms