Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYD88Q99836 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYD88Q99836 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYD88Q99836 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYD88Q99836 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MYD88Q99836 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYD88Q99836 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYD88Q99836 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYD88Q99836 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYD88Q99836 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYD88Q99836 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYD88Q99836 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYD88Q99836 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYD88Q99836 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYD88Q99836 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYD88Q99836 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYD88Q99836 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYD88Q99836 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYD88Q99836 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYD88Q99836 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYD88Q99836 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYD88Q99836 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYD88Q99836 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYD88Q99836 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYD88Q99836 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYD88Q99836 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYD88Q99836 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYD88Q99836 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYD88Q99836 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYD88Q99836 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYD88Q99836 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYD88Q99836 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYD88Q99836 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYD88Q99836 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYD88Q99836 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYD88Q99836 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYD88Q99836 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MYD88Q99836 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MYD88Q99836 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYD88Q99836 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MYD88Q99836 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYD88Q99836 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYD88Q99836 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms