Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPS8Q99627 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms