Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMD1Q99460 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMD1Q99460 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms