Protein–RNA interactions for Protein: Q96SM3

CPXM1, Probable carboxypeptidase X1, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPXM1Q96SM3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms