Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms