Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
IFT140Q96RY7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
IFT140Q96RY7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
IFT140Q96RY7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
IFT140Q96RY7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
IFT140Q96RY7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
IFT140Q96RY7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
IFT140Q96RY7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
IFT140Q96RY7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.82■■■■□ 3.32
IFT140Q96RY7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
IFT140Q96RY7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
IFT140Q96RY7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
IFT140Q96RY7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
IFT140Q96RY7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
IFT140Q96RY7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
IFT140Q96RY7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
IFT140Q96RY7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
IFT140Q96RY7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
IFT140Q96RY7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
IFT140Q96RY7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
IFT140Q96RY7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
IFT140Q96RY7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
IFT140Q96RY7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
IFT140Q96RY7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
IFT140Q96RY7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
IFT140Q96RY7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
IFT140Q96RY7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
IFT140Q96RY7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
IFT140Q96RY7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
IFT140Q96RY7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
IFT140Q96RY7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
IFT140Q96RY7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
IFT140Q96RY7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
IFT140Q96RY7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
IFT140Q96RY7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
IFT140Q96RY7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
IFT140Q96RY7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
IFT140Q96RY7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
IFT140Q96RY7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
IFT140Q96RY7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
IFT140Q96RY7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
IFT140Q96RY7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
IFT140Q96RY7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.8■■■■□ 3.32
IFT140Q96RY7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
IFT140Q96RY7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
IFT140Q96RY7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms