Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms