Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms