Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms