Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK2

RIPOR3, RIPOR family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPOR3Q96MK2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RIPOR3Q96MK2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms