Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFAP53Q96M91 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFAP53Q96M91 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFAP53Q96M91 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFAP53Q96M91 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFAP53Q96M91 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CFAP53Q96M91 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFAP53Q96M91 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFAP53Q96M91 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CFAP53Q96M91 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CFAP53Q96M91 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CFAP53Q96M91 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CFAP53Q96M91 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CFAP53Q96M91 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CFAP53Q96M91 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CFAP53Q96M91 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CFAP53Q96M91 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CFAP53Q96M91 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CFAP53Q96M91 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CFAP53Q96M91 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CFAP53Q96M91 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CFAP53Q96M91 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CFAP53Q96M91 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CFAP53Q96M91 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CFAP53Q96M91 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFAP53Q96M91 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFAP53Q96M91 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFAP53Q96M91 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms