Protein–RNA interactions for Protein: Q96LL4

C8orf48, Uncharacterized protein C8orf48, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf48Q96LL4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms