Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms