Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms