Protein–RNA interactions for Protein: Q96IQ7

VSIG2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG2Q96IQ7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VSIG2Q96IQ7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms