Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms