Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms