Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NMD3Q96D46 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NMD3Q96D46 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NMD3Q96D46 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NMD3Q96D46 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NMD3Q96D46 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NMD3Q96D46 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NMD3Q96D46 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NMD3Q96D46 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NMD3Q96D46 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NMD3Q96D46 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NMD3Q96D46 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NMD3Q96D46 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms