Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GCC1Q96CN9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms