Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ5

CCDC127, Coiled-coil domain-containing protein 127, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC127Q96BQ5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC127Q96BQ5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC127Q96BQ5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms