Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTSSAQ969W0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms