Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms