Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKD2Q969F2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms