Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF3C6Q969F1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
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