Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms