Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PRG4Q92954 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms