Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms