Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms