Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms