Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAE8

GADD45GIP1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GADD45GIP1Q8TAE8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms