Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms