Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC148Q8NFR7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms