Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ5

GPRC5A, Retinoic acid-induced protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPRC5AQ8NFJ5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPRC5AQ8NFJ5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPRC5AQ8NFJ5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GPRC5AQ8NFJ5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPRC5AQ8NFJ5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GPRC5AQ8NFJ5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPRC5AQ8NFJ5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPRC5AQ8NFJ5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPRC5AQ8NFJ5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPRC5AQ8NFJ5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPRC5AQ8NFJ5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPRC5AQ8NFJ5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPRC5AQ8NFJ5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPRC5AQ8NFJ5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GPRC5AQ8NFJ5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GPRC5AQ8NFJ5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPRC5AQ8NFJ5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPRC5AQ8NFJ5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPRC5AQ8NFJ5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPRC5AQ8NFJ5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms