Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEU8

APPL2, DCC-interacting protein 13-beta, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL2Q8NEU8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APPL2Q8NEU8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms