Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB49

ATP11C, Phospholipid-transporting ATPase IG, humanhuman

Predictions only

Length 1,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11CQ8NB49 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP11CQ8NB49 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP11CQ8NB49 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP11CQ8NB49 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP11CQ8NB49 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP11CQ8NB49 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP11CQ8NB49 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11CQ8NB49 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11CQ8NB49 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11CQ8NB49 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11CQ8NB49 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11CQ8NB49 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11CQ8NB49 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11CQ8NB49 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11CQ8NB49 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11CQ8NB49 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11CQ8NB49 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11CQ8NB49 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11CQ8NB49 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11CQ8NB49 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11CQ8NB49 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11CQ8NB49 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP11CQ8NB49 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP11CQ8NB49 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP11CQ8NB49 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP11CQ8NB49 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP11CQ8NB49 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP11CQ8NB49 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP11CQ8NB49 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP11CQ8NB49 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP11CQ8NB49 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP11CQ8NB49 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms