Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PROM2Q8N271 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms