Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0S2

SYCE1, Synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1Q8N0S2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms