Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYCP3Q8IZU3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms