Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYK4

COLGALT2, Procollagen galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT2Q8IYK4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COLGALT2Q8IYK4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COLGALT2Q8IYK4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COLGALT2Q8IYK4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COLGALT2Q8IYK4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COLGALT2Q8IYK4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COLGALT2Q8IYK4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COLGALT2Q8IYK4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COLGALT2Q8IYK4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COLGALT2Q8IYK4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COLGALT2Q8IYK4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COLGALT2Q8IYK4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COLGALT2Q8IYK4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
COLGALT2Q8IYK4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
COLGALT2Q8IYK4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COLGALT2Q8IYK4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COLGALT2Q8IYK4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COLGALT2Q8IYK4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COLGALT2Q8IYK4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms