Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms