Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM139Q8IV31 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM139Q8IV31 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM139Q8IV31 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM139Q8IV31 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM139Q8IV31 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM139Q8IV31 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM139Q8IV31 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms