Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
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RAB11FIP4Q86YS3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
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RAB11FIP4Q86YS3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
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RAB11FIP4Q86YS3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
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RAB11FIP4Q86YS3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB11FIP4Q86YS3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
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