Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z0

KRT25, Keratin, type I cytoskeletal 25, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT25Q7Z3Z0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT25Q7Z3Z0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT25Q7Z3Z0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT25Q7Z3Z0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT25Q7Z3Z0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT25Q7Z3Z0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT25Q7Z3Z0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT25Q7Z3Z0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT25Q7Z3Z0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT25Q7Z3Z0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT25Q7Z3Z0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT25Q7Z3Z0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT25Q7Z3Z0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT25Q7Z3Z0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT25Q7Z3Z0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT25Q7Z3Z0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT25Q7Z3Z0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT25Q7Z3Z0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT25Q7Z3Z0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT25Q7Z3Z0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT25Q7Z3Z0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT25Q7Z3Z0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT25Q7Z3Z0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT25Q7Z3Z0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT25Q7Z3Z0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms