Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3J3

RGPD4, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4Q7Z3J3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD4Q7Z3J3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RGPD4Q7Z3J3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RGPD4Q7Z3J3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RGPD4Q7Z3J3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RGPD4Q7Z3J3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms