Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms